登Science，MIT團隊推出新蛋白質語言模型ProtGPS，預測蛋白在活細胞內的功能位置
編輯 | 蘿卜皮蛋白質是維持細胞運轉的主要動力，細胞中有成千上萬種蛋白質，每種蛋白質都發揮著特殊的功能。研究人員早就知道，蛋白質的結構決定了它的功能。最近，科學家逐漸意識到，蛋白質的定位對其功能也至關重要。細胞中充滿了有助于組織眾多細胞成分的隔間。
首頁 > 蛋白
蛋白
-
-
改進蛋白突變穩定性預測，清華龔海鵬團隊AI蛋白工程模型登Nature子刊
編輯 | KX準確預測蛋白質突變效應在蛋白質工程和設計中至關重要。近日，清華大學龔海鵬團隊提出了一套基于幾何學習的模型套件——GeoStab-suite，其中包含 GeoFitness、GeoDDG 和 GeoDTm 三個模型，分別用于預測蛋白質突變后的適應度得分、ΔΔG 和 ΔTm。GeoFitn
-
不懂AI、不會編碼？如何輕松拿捏AlphaFold準確預測蛋白結構
自 2021 年公開發布以來，用 AlphaFold2 (AF2) 預測蛋白質結構研究生物學問題，已經成為一種常見做法。ColabFold-AF2 是 Google Colaboratory 內部的開源Jupyter Notebook，也是一個命令行工具，可讓你輕松使用 AF2，同時
-
中新健康丨國際最新研究：機器學習模型檢測血液蛋白或有助于預測帕金森病
中新網北京6月19日電 (記者 孫自法)施普林格·自然旗下學術期刊《自然-通訊》最新發表一篇醫學研究論文認為，通過機器學習模型檢測血液中的蛋白質，或有助于最早在運動癥狀出現前7年預測帕金森病的發生。帕金森病是一種神經退行性疾病，癥狀表現為行動遲緩、僵硬和靜止性顫抖。在出現運動癥狀前，會有一段時間出現
-
高精度預測蛋白構象變化，中國科大、上科大通用深度學習模型
編輯 | KX預測蛋白質構象變化是計算生物學和人工智能領域的一大挑戰。主流的 AlphaFold 等算法可以高通量預測蛋白質的靜態結構，但對蛋白質構象變化預測卻束手無策。為了解決這個問題，中國科學技術大學和上海科技大學的研究人員，提出了一種新穎的深度學習策略，即利用高通量生物物理采樣來規避與蛋白質構
-
基于AI平臺，天壤智能設計出新冠刺突蛋白結合劑
ACE2，即血管緊張素轉換酶2，是SARS-CoV-2進入細胞所需的受體，在SARS-CoV-2入侵宿主細胞的過程中起著至關重要的作用。而新冠刺突蛋白結合劑具有和S蛋白結合的能力，從而成為SARS-CoV-2病毒的誘餌受體。通過與病毒競爭性結合，有效防止病毒與細胞表面的天然ACE2結合，進而阻止病毒
-
ScienceAl2024「AI+蛋白&核酸&分子互作」專題年度回顧
編輯 | 蘿卜皮2024年，科學界迎來了重要的突破與創新，尤其是在人工智能與結構生物學的結合領域。正如今年諾貝爾獎頒發所體現的那樣，人工智能（AI）技術的迅猛發展正在推動各學科的深度融合，揭示了生命科學研究的新機遇與前景。
-
復旦學者提出蛋白解析新算法，相關代碼已在GitHub開源
近日，復旦大學復雜體系多尺度研究院院長馬劍鵬和團隊，研發出一款名為 OPUS-DSD（OPUS deep structural disentanglement）的算法。它能大大提升蛋白質結構測試精度，并能測出以往方法所無法測出的部分。
-
Science子刊，斯坦福AI方法表示蛋白互作節點，增強功能識別與PPI推理
編輯 | 白菜葉生物網絡通過詳細描繪基因、蛋白質及其他細胞成分之間的復雜相互作用，為建模生物系統提供了重要工具。這些網絡將實體表示為節點，將其相互作用（從物理連接到功能關聯）表示為邊，從而為解析生物系統和過程的復雜性奠定了基礎。例如，在蛋白質-蛋白質相互作用（PPI）網絡中，復雜的連接關系包含了理解
-
ProteinBLAST會成為過去嗎？AlphaFold等對蛋白結構的搜索是否會取代對序列的搜索
像 AlphaFold 這樣的蛋白質結構搜索工具會用 BLAST 取代蛋白質序列搜索嗎？德累斯頓工業大學的研究團隊討論了使用結構搜索進行遠程同源性檢測的前景，以及為什么蛋白質 BLAST 作為領先的序列搜索工具應努力納入結構信息。
